На работе часто из-за работы антивируса или вируса :) не удается корректно извлечь флешку из машин, приходится просто выдергивать. После 2-3 таких извлечений, дома в Ubuntu флешка системой не видится (не монтируется из за ошибок в ФС).
Решается так:
sudo fsck.vfat /dev/sdb1
Здесь sdb1 раздел флешки. Узнать какое имя присвоено разделу можно с помощью dmesg.